超ベガ曲射砲の直撃で、ベルリンが消滅した。
地球には不安と悪意が蔓延し、その矛先はデュークに向けられつつある。
ルビーナはデュークと密かに契り、ベガ王家とフリード王家を結びつけることで、これ以上の争いを止めようとしていた。
一方、光子力研究所の仲間を失い、甲児とさやかはベガ星連合軍への復讐を誓うのだった。